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Cara, vai parecer óbvio, mas é a real: você vai ter que tentar uns dois ou três programas diferentes até obter o resultado desejado. Por mais que os aplicativos possam, aparentemente, oferecer os mesmos recursos, como o formato e a qualidade do vídeo e seu áudio, a renderização e resultado final acabam sendo diferentes. Pesquise alguns bons programas e faça o teste. 

Abraço.

Avidemux. Fácil e leve

procuro um programa mais leve possivel e pequeno q não exija muito da maquina pq meu PC é antigo

o Photoshop CS5 faz isso. procure na intetnet um tutorial sobre isso.

para realizar essa tarefa, use o formatfactory. é muito simples: escolha o formato de saída (avi, mp4, rmvb... são várias opções), adicione o vídeo desejado clicando em 'adicionar arquivo' ou arrastando o vídeo para dentro da janela, clique em 'opções', aí vá até 'ajustar faixa' e então defina o início e término do vídeo em 'tempo inicial' e tempo final'. clique em ok. se quiser redefinir a resolução do vídeo, clique em 'configurações de saída'

http://www.techtudo.com.br/tudo-sobre/s/formatfactory.html

Eu usava o Nero Vision para editar vídeos, a versão era parte do pacote completo do Nero, mas agora existe a versão "Nero Vision Xtra" grátis que tem mais recursos, baixe do link:

http://www.superdownloads.com.br/download/48/nero-vision-xtra/