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Tive o mesmo problema e consegui recuperar os arquivos com essa dica:

http://www.neriojunior.com.br/2016/03/erro-no-hd-externo-pastas-nao-abrem.html

Olá novamente hosantos.

Além do que o marcmira falou, tem outra possibilidade, na hora em que você desconectou o HD, como ele ainda estava trabalhando, pode ter danificado o disco, use um programa de diagnóstico para verificar se não há bad blocks no seu disco. Caso tenha tente recuperar usando um programa de recuperação de dados, existem vários gratuitos online. 

Espero que consiga recuperar seus arquivos.

Abraço.

vamos passar a escrever sem caps lock, netiqueta agradece.

teste esse link, veja se reaparece os arquivos, ainda suspeito de malware nesse caso:

http://www.techtudo.com.br/dicas-e-tutoriais/noticia/2013/11/como-remover-virus-que-transforma-arquivos-do-pen-drive-em-atalhos.html

apesar de estar um pendrive, funciona em hd externo.

att

Certo, valeu, ele não caiu e não estar fazendo barulho, acho que danificou quando eu puxei sem modo de segurança, tinha umas pastas em aberto.

Olá hosantos.

Seu HD Externo sofreu alguma queda, ou algo que possa ter afetado seu funcionamento? Ele está fazendo algum barulho?

Acredito que você deveria antes de mais nada verificar se não há vírus em seu HD.
Depois faça um diagnóstico de seu HD, se você entrar no site do fabricante de seu HD certamente fai encontrar algum programa de diagnóstico da própria fabricante.

Tente esses procedimentos primeiro, caso não funcione, você pode achar online alguns outros programas que poderão ser úteis para recuperação de dados.

Espero ter ajudado.

Abraço.