Por que não tenta restaurar o sistema? Não me parece nenhuma configuração errada e sim um erro que possa ter acontecido com o uso mesmo.

O problema pode ser no disco, então execute um utilitário para verificar:
1) No “Windows explorer” clique com o botão direito no disco removível e escolha “propriedades”.
2) Na nova janela selecione a aba “Ferramentas” e clique no botão “Verificar agora”.
3) Na nova janela “Verificar disco local” marque a opção ”Procurar setores defeituosos e tentar recupera-lo” e clique no botão “Iniciar”.
4) Vai acontecer uma demorada verificação do disco.
Se for só um problema de formato ele será corrigido automaticamente. Se aparecer algum setor defeituoso ele será isolado, mas será melhor trocar o disco, porque geralmente novos setores defeituosos surgirão.

Geralmente isso acontece com algum ''virusinho''. rs

Tenta passar um antivirus no pc e no HD.

Oi Tony eu concordo com o Gcossenzo isto Muito provavelmente mesmo é um vírus, o que você deve fazer é em primeiro vai no seu notebook e faça um backup de todos os dados de seu HD externo, depois disso vai no pc que está com virus atualiza o antivirus e faz uma varredura completa, se você estiver sem antivírus pode instalar o avast mesmo, que é gratis e quebra o galho, depois de você tirar o virus do PC, eu recomendo formatar hd externo para ter certeza que não vai sobrar virus nele, dai pra formatar o hd você pode seguir o tutorialzinho sobre formatação de hd externo.

Como formatar o HD

http://formataropc.com/formatar-hd-em-7-passos/

Como instalar o Avast

http://www.baixaki.com.br/guias/Como-Instalar-Avast-Home-Edition.htm

Cara arrume um cd bootavel do Linux e inicie o computador direto pelo CD, vc vai conseguir fazer o backup dos seus arquivos, e ainda deletar os virus que esteja causando o problema...

Cara arrume um DVD bootavel do Linux, inicie o sistema direto do DVD, que você vai conseguir fazer o backup de todos os seus arquivos, e talvez se tiver sorte deletar o virus que esteja causando o problema... Boa Sorte!

Entre no explorer e navegue até a opção de "opções de pastas e pesquisa", abra todas as abas do ecrã e clique na opção: "restaurar padrões", deve resolver.