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Geralmente as placas de vídeo necessitam ventoinhas com maior rotação, se chega a funcionar normal é sinal que o problema é aquecimento!

Mas mudou também o dissipador?
Qual o modelo da placa de vídeo?

Se retirar o dissipador tem que trocar a pasta térmica, usa uma pasta térmica de base cerâmica, que é mais eficiente.
É importante ligar a ventoinha na placa de vídeo, pois a velocidade aumenta de acordo com a temperatura do Processador gráfico (GPU).

Usa um programa para verificar a temperaturas e a velocidades da ventoinhas, pode ser o HWMonitor: https://www.cpuid.com/softwares/hwmonitor.html

Repara no exemplo que a GTX-580 com 83°c a rotação da ventoinha está em 3240rpm, mas quando a temperatura estava a 91°c a rotação da ventoinha chegou a 3840rpm;

Acontece que o gpu esta esquentando muito e o pc reinicia, para nao queimar o gpu, troque o cooler da vga ou use o video onboard ate resolver